軍方和穆兄會的博弈仍將繼續
儘管民選總統的結果最終出爐了，但是埃及民主過渡進行遠未結束。埃及武裝部隊最高委員會通過之前剛剛發佈的《憲法宣言》修正案將總統權力壓縮至了最低限度，而將自身權力最大化。
埃及軍方賦予自身以下幾大權力。首先，由於埃及人民議會已被解散，埃及武裝部隊最高委員會將在新人民議會選舉産生前代行相關職責。其次，軍隊有權決定自身的一切事務，不受民選政府的監督和領導。第三，軍方在新憲法制定中擁有至高無上的地位，若制憲委員會不能正常工作，埃及武裝部隊最高委員會將提名組建新制憲委員會。第四，軍隊擴大了其在維護國內治安上的地位，並收回了對外宣戰權。
但是，來自穆兄會的穆爾西一旦就任總統後，軍方必然要同新總統分享部分權力。美國喬治 華盛頓大學中東問題專家內森 布朗認為，穆爾西會在除國防和外交外的內政問題上擁有相當大的發言人，武裝部隊最高委員會擁有立法權，但是法律需要總統簽字才能生效，因此穆兄會和軍方會形成一種相互制約的關係。目前尚存疑問的是，軍方取得了制定新憲法的最高發言權，軍方是否會在新憲法中規定本次選舉的只是過渡總統、新憲法出臺後還將舉行正式總統選舉？這一點尚需觀察。
