11月15日，經常爆料高捷弊案的臺灣無黨籍民意代表邱毅透露，自從高捷案爆發後，臺當局“行政院長”謝長廷已經二度致電給他，謝長廷還在首次致電時表示，“高捷案只要不查到皇帝娘娘（陳水扁夫人吳淑珍）那裏，應該都查得下去”。對此，臺當局“行政院”只是證實謝長廷曾經致電給邱毅，但否認有上述內容。

　　一時間“皇帝娘娘”之説開始為人關注。

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　　此後，“皇帝娘娘説”愈講愈熱，吳淑珍、謝長廷和高雄捷運公司的關係引人關注。雖然諸多言論直指陳水扁妻子吳淑珍與高捷弊案有關聯，但究意吳淑珍在高捷案中扮演什麼角色，一直無人敢點明。臺灣TVBS電視臺最近挖出了兩年多前的新聞片，發現吳淑珍當時是高捷的“輕軌捷運”形象代言人。

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　　不過，謝長廷始終拒絕承認説過“皇帝娘娘”，11月16日，謝長廷撂下狠話，聲稱“若有人可以舉發他説過，願意下臺”。這已經是謝長廷為高捷案第二度祭出“下臺”王牌。而邱毅則發重誓，誰説謊被車撞死。

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　　17日，邱毅更進一步表示，在“立法院”開會前召開記者會表示，如果臺當局“行政院長”謝長廷在9月30日與他的對話中沒説過“皇帝娘娘”一詞，那麼他就辭去“立委”。而昨天，謝長廷剛剛表示，若自己有説過“皇帝娘娘”，願意下臺。

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　　到底有無“皇帝娘娘”一説，真相肯定只有一個，雖然我們無法知道究竟事實為何，但“皇帝娘娘”説的確以邱毅和謝長廷之間互相的“互相”鬥嘴而熱乎了一陣。