根據中央規定，出席中國共産黨第十六次全國代表大會的代表團增加了中央企業系統代表團和中央金融系統代表團，這是中央企業系統和中央金融系統首次單獨組團參加黨的全國代表大會。與十五大的36個代表團相比，十六大的代表團增加到38個。

　　此外，不是十六大代表的十五屆中央委員會委員、候補委員和中央紀律檢查委員會委員；不是十六大代表、特邀代表的原中央顧問委員會委員；不是十六大代表、特邀代表的黨內部分老同志，以及其他有關同志，共284人列席了這次大會。大會還邀請了擔任全國人大常委會副委員長、全國政協副主席的黨外人士，擔任過國家副主席、全國人大常委會副委員長、全國政協副主席的黨外人士，各民主黨派中央、全國工商聯負責人和無黨派人士，以及全國人大、全國政協常委中在京的黨外人士和部分少數民族、宗教界人士等，共152人作為來賓列席大會開幕式和閉幕式。

　　這次大會的主題是：高舉鄧小平理論偉大旗幟，全面貫徹“三個代表”重要思想，繼往開來，與時俱進，全面建設小康社會，加快推進社會主義現代化，為開創中國特色社會主義事業新局面而奮鬥。

　　大會的議程為：（1）聽取和審查十五屆中央委員會的報告；（2）審查中央紀律檢查委員會的工作報告；（3）審議通過《中國共産黨章程（修正案）》；（4）選舉十六屆中央委員會；（5）選舉新一屆中央紀律檢查委員會。

　　李鵬同志主持了大會開幕式。

　　江澤民同志代表第十五屆中央委員會向大會作了題為《全面建設小康社會，開創中國特色社會主義事業新局面》的報告。報告共分十個部分：一、過去五年的工作和十三年的基本經驗；二、全面貫徹“三個代表”重要思想；三、全面建設小康社會的奮鬥目標；四、經濟建設和經濟體制改革；五、政治建設和政治體制改革；六、文化建設和文化體制改革；七、國防和軍隊建設；八、“一國兩制”和實現祖國的完全統一；九、國際形勢和對外工作；十、加強和改進黨的建設。

　　江澤民同志主持大會閉幕式併發表講話。

　　大會通過了《關於十五屆中央委員會報告的決議》、《關於〈中國共産黨章程（修正案）〉的決議》（這一修正案自通過之日起生效）、《關於中央紀律檢查委員會工作報告的決議》。

　　大會以無記名投票方式，選舉出由198名委員、158名候補委員組成的十六屆中央委員會，選舉出由121名委員組成的中央紀律檢查委員會。