來自馬尾海關的消息，自二00一年一月二日“兩馬直航(福建馬尾—臺灣馬祖)”首航以來，至二零零六年八月，經此航線往返兩岸的客輪共一千七百八十五航次，旅客人數達十萬四千余人次。

　　據馬尾海關負責人介紹，“兩馬直航”自開通以來，以其經濟、便捷、省時的優勢，越來越受到臺胞的青睞。直航管理也從最初“個案處理”發展為“通案模式”，再到目前的“常態化”。

　　特別是近年來隨著兩岸經貿、文化交流的日益密切，該航線旅客人數連年增長。據估算，目前“兩馬”航線年客流量超過二00一年開通當年的客流量十倍以上。

　　針對“兩馬”客運量不斷增長的情況，馬尾海關加強人員配置，並且在旅檢現場積極推動“巾幗文明服務示範崗”常態化活動，包括設置“綠色通道”、簡化通關手續、設立旅客休息室、提供暈船藥、飲用水等，以優質熱情的服務確保往返兩岸的臺胞順利通關。