投入不足，歷史欠賬多；大部分城市採取標準規範的下限
據住房和城鄉建設部2010年對國內351個城市排澇能力的專項調研顯示，2008年—2010年間，有62%的城市發生過不同程度的內澇，其中內澇災害超過3次以上的城市有137個；在發生過內澇的城市中，57個城市的最大積水時間超過12小時。
住建部有關負責人認為，近年來城市內澇呈現發生範圍廣、積水深度大、滯水時間長的特點，這直接反映出目前城市排水管網覆蓋率、設施排澇能力偏低等問題。如北京市近10年來，城市建成區面積增加了一倍，但地下管網等基礎設施建設卻沒有跟上，排水管網系統早已不堪重負。
按照2011年最新修訂的《室外排水設計規範》的要求，城市一般地區排水設施的設計暴雨重現期為1—3年（即抵禦1—3年一遇的暴雨），重要地區3—5年。但在實施過程中，大部分城市普遍採取標準規範的下限。調查顯示我國70%以上的城市排水系統建設的設計暴雨重現期小于1年，90%老城區的重點區域甚至比規範規定的下限還要低。比如北京，目前僅有天安門廣場和奧林匹克公共區的排水管線達到５年一遇，即滿足每小時５６毫米的降雨量；中心城區普遍按１年一遇的標準建設。
城市基礎設施長期投入不足，歷史欠賬多，也是導致內澇頻現的重要原因。據《2009中國城市建設統計年鑒》統計，用於市政基礎設施的財政性資金，僅有4%投入到排水系統建設維護中，難以按標準規定進行定期養護。
中國水科院防洪抗旱減災研究所副所長向立雲還指出，城市蓄水能力下降也是重要原因。現在城市地面大量硬化，不透水面積增加，同時為了突出城市景觀，幾乎所有的綠地都高出地面，嚴重影響城市蓄水。
