署理陜甘總督李侍堯奉旨清查各地監糧，發現不僅沒有貯存監糧，而且平時國庫應該存儲的正項存糧也虧空了。甘肅正項倉庫虧空糧米74000多石，地方財政虧空銀子88萬多兩。甘肅不僅所謂的監糧已經有名無實，就是國庫中應該保存的種子糧和口糧也被官員們肆意侵佔了。

　　此時，面對鐵證如山的破案結果，勒爾謹、王亶望、王廷讚等人再也無法狡辯了，只好低頭認罪了。在審訊王亶望的時候，大學士九卿問他：“為什麼如此大膽”，敢做這種貪婪不法之事的時候，王亶望回答：“我做這樣的事，起初若想到今日被發覺也斷不敢做。只是我貪心重了，想上下合為一氣，各自分肥；又令該省道府等出結存案，希冀可以蒙混；有散賑可以借端掩飾，不至敗露出來，所以就大膽做了。”

　　在王亶望看來，官員們上下一氣，對付皇上；大家分肥，對付左右；散賑行善，對付百姓，這樣的確是一件天衣無縫的事，若不是下大雨引起乾隆皇帝的懷疑，這件事最終隱瞞到底也未可知。

　　而面對這樣一個破案結果，乾隆氣得大呼此為“從來未有之奇貪異事！” “當以重法治之！”的確，甘肅此案，案情之嚴重，情節之惡劣，侵吞銀數之多，堪稱清朝立國以來罕見的第一大貪污案。以往成百上千的案子，或是單個作案，或是上司夥同三五屬員納賄索財，像這樣從總督開始，以布政使為首， “全省大小官員無不染指有罪”，大規模的“上下一氣”的集體作案，在清朝開國以來一百多年的歷史上，還真是第一次。

　　甘肅捐監冒賑案，全省官員幾乎無不染指，如果依法懲處，甘肅官場將為之一空，這對西北部邊疆的安定非常不利，作為一國之君乾隆皇帝該怎麼辦呢？是下狠手懲治這些貪官？還是只處罰首要官員？

　　本來，在查案初期，考慮到大清吏治在百姓中的形象，乾隆並不想把甘肅冒賑案的影響搞得太大，但是隨著調查的深入，乾隆的思想越來越矛盾，因為暴露的積弊越來越多，牽連的貪官也越來越多，一向以“十全老人”自居的乾隆皇上現在已經被徹底激怒了：我在這些貪官心中還是至高無上的皇帝嗎？恐怕只是一只被耍的猴兒吧？！

　　當了七年“冤大頭”的恥辱讓乾隆忍無可忍，他徹底放棄了法不責眾的打算，並說：“中外人才不乏，斷無少此數人便不能辦事之理。此而不嚴行查辦，將何事不可為也？”