但是，國共合作並非一帆風順，在波瀾壯闊的大革命洪流中也潛伏著令人不安的暗流。1924年6月，國民黨內的右派分子鄧澤如、張繼、謝持向國民黨中央執行委員會提出《彈劾共産黨案》，聲稱共産黨員加入國民黨“于本黨之生存發展，有重大妨害”，“絕對不宜黨中有黨”。8月，張繼等又拋出所謂《護黨宣言》，誣衊共産黨員加入國民黨的目的是消滅國民黨。

　　面對國民黨右派的進攻，中共中央于7月1日發出黨內通告，要求各級黨組織堅決揭露國民黨右派的反動活動。陳獨秀、惲代英、瞿秋白、蔡和森等連續發表文章，痛斥國民黨右派違背國民黨一大政綱、破壞革命隊伍內部團結的反動言行。此刻，擺在共産黨人面前的重要問題是：在這場日益高漲的大革命浪潮中，共産黨人是應當在國民黨的旗幟下為了國民革命運動去組織中國工人、農民以及青年，還是應當由共産黨直接去組織群眾？

　　為了總結國共合作一年來的經驗，加強對革命運動的領導，回答黨所面臨的許多新問題，1925年1月11日至22日，中國共産黨第四次全國代表大會在上海召開。出席大會的有陳獨秀、蔡和森、瞿秋白、譚平山、周恩來、彭述之、張太雷、陳潭秋、李維漢、李立三、王荷波、項英、向警予等20人，代表著全國994名黨員。共産國際代表維經斯基參加了大會。陳獨秀代表第三屆中央執行委員會作了工作報告。

中共四大宣言和決議案

　　大會圍繞當前的中心工作，通過了《對於民族革命運動之議決案》等11個議決案，並選出了新的中央執行委員會。新當選的中央執行委員共9人：陳獨秀、李大釗、蔡和森、張國燾、項英、瞿秋白、彭述之、譚平山、李維漢；候補執行委員5人：鄧培、王荷波、羅章龍、張太雷、朱錦堂。在隨後舉行的中央執行委員會第一次會議上，陳獨秀當選為中央總書記兼中央組織部主任，彭述之任中央宣傳部主任，張國燾任中央工農部主任，蔡和森、瞿秋白任中央宣傳部委員，以上5人組成中央局。

　　黨的四大最重要的貢獻是第一次明確提出了無産階級在民主革命中的領導權和工農聯盟問題。《對於民族革命運動之議決案》明確指出：“無産階級的政黨應該知道無産階級參加民族運動，不是附屬資産階級而參加，乃以自己階級獨立的地位與目的參加”。“無産階級是最有革命性的階級”。所以，民主革命“必須最革命的無産階級有力的參加，並且取得領導的地位，才能夠得到勝利”。關於工農聯盟，《對於農民運動的議決案》闡明瞭農民是無産階級同盟軍的原理，強調了農民在中國民族革命中的重要地位，指出：如果不發動農民起來鬥爭，無産階級的領導地位和中國革命的成功是不可能取得的。此外，大會對中國民主革命的內容作了較完整的規定，指出在“反對國際帝國主義”的同時，既要“反對封建的軍閥政治”，又要“反對封建的經濟關係”，這表明，此時黨已把新民主主義革命基本思想的要點提出來了。

　　黨的四大作出的各項正確決策，為大革命高潮的到來作了政治上、思想上和組織上的準備。此後，全國的革命形勢迅速發展，工人運動風起雲湧，農民運動轟轟烈烈，大革命的高潮來臨了。