積極促進包機的節日化、常態化。
供銷總社宣佈準備組團赴臺採購。
中國閩臺緣博物館在福建泉州建成開館。
開放臺灣同胞參加報關員考試。
5月6日
2006海峽兩岸中醫藥學術論壇在臺北開幕。
5月8日
由臺灣新竹縣議長張碧琴為團長的臺灣客家文化交流之旅參訪團一行26人近日前往福建寧化石壁祭祖。張碧琴議長表示，這次祭祖讓兩岸客家宗親彼此更加接近、融洽。
5月10日
中央軍委副主席、國務委員兼國防部長曹剛川在北京會見美軍太平洋總部司令威廉 法倫。曹剛川説，臺灣問題攸關中國的核心利益，希望美方明確反對“臺獨”，明確支援中方為維護臺海和平穩定、改善和發展兩岸關係所做出的積極努力，停止美臺軍事交往。
5月14日
廈門和金門相關部門日前在2006年第三季度“小三通”航班調度會上達成共識，自今年7月1日起，廈金“小三通”航班每天將由原來往返12航班增加至16航班。並且，根據客流量增加情況，雙方在月度航班會可以再行協商將航班增至每天20航班。
5月16日
2006年(第五屆)兩岸倫理學術研討會在臺北舉行。
5月17日
國臺辦發言人李維一表示，對於包機我們歷來的態度是明確的、一貫的，我們在積極促進包機的節日化、常態化，以至實現兩岸直接的通航。
在國臺辦例行新聞發佈會上，國家海關總署關稅徵管司司長高融昆宣佈，開放臺灣同胞參加報關員考試，成績合格者在報名地海關即可申請報關員資格證書。
5月20日
海峽兩岸佛教文化學術研討會在福州涌泉寺舉行，以鼓山法係為代表的兩岸佛教界高僧大德一千多人出席了開幕式和祈福法會。國家宗教局副局長齊曉飛等有關領導到場祝賀。
5月23日
福建省莆田市湄洲島與金門縣有關方面分別組團首次從海上直航互遊。
5月25日
中國統促會與來訪的澳大利亞中國統一促進會訪問團一行在京舉行座談會，第九屆全國政協副主席、中國統促會名譽會長王文元出席座談會併發表講話。
5月27日
國家級對臺專題博物館——中國閩臺緣博物館在福建泉州建成開館。
5月28日
中國統促會與來訪的全球反“獨”促統聯盟訪問團一行在北京舉行座談會，全國人大常委會副委員長、中國統促會副會長許嘉璐出席座談會併發表講話。
5月30日
中國駐希臘大使田學軍陪同訪問希臘的國務院臺辦主任陳雲林會見了希外交部副部長卡西米斯、第一副議長哈齊哈基斯和議會外交與國防事務委員會主席卡邁諾斯，雙方就臺海形勢及兩岸關係交換了意見。希方表示，希堅持一個中國原則，反對“臺獨”，支援中國人民按照“一國兩制”原則實現和平統一大業。
5月31日
國臺辦發言人李維一在國臺辦例行新聞發佈會上表示，“國安報告”系統地匯集了陳水扁當局的“臺獨”分裂主張，並且集中全面地誣衊和攻擊祖國大陸，蓄意離間兩岸同胞的感情。李維一強調，這份報告並不會改變和平穩定方向發展的良好勢頭，我們將繼續以最大的誠意，盡最大的努力，來維護和促進兩岸關係的和平穩定的發展。
供銷總社辦公廳副主任楊佔科在發佈會上表示，大陸一貫的惠臺政策有利於消除臺果“登陸”困難，有利於兩岸農業發展雙贏。並表示，供銷總社正認真組織精選優勢企業和組織組團赴臺採購。
農業部辦公廳副主任何子陽表示，海峽兩岸農業交流與合作發展迅速，目前已成為兩岸經濟發展的新的增長點。
資料來源：台灣網評論中心
