據臺灣“今日新聞網”報道，臺灣當局外事部門副負責人史亞平今(25日)表示，臺灣漁船案調查報告由法務部門負責，外事部門會全力配合，有聲音指出，外事部門與法務部門就調查報告的公佈時間，有不同意見，她否定這樣的説法。
消息指出，針對“廣大興28號”漁船射擊案調查已經完成，但菲方目前還在等後總統阿基諾三世(Benigno Aquino III)做最後的定奪，但在此之前，外事部門與法務部門又對調查報告的公佈時間點有不同看法。
史亞平表示，調查報告屬於司法調查部分，當然由法務部門來負責，外事部門會盡力來配合，絕對沒有與法務部門對時間點出現歧見的情況。至於菲國部分，還是希望對方能儘快提出報告結果，讓事情真相大白。
消息指出，臺灣與菲方調查報告在起訴的罪名上有相當落差，臺方認定對方蓄意殺人，必需依法起訴；但菲國卻認為菲海巡人員自衛過當。
對此外事部門負責人林永樂日前也坦言，臺當局的目標，就是希望雙方的報告結果與起訴罪名能差不多。至於公佈時間，他認為應該就在近期，但主動權還是在菲方。
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