臺北市政府廉政透明委員會到底在做什麼？又想做什麼？相信是許多民眾都深感好奇的問題。我們願意相信，當柯文哲挾其壓倒性得票率就任臺北市長之初，大力推動成立這個委員會，應出於發掘真相、檢討弊案的公共善意，可惜的是，事實證明這個委員會已成為破壞法治的亂源，本身就是必須正視與改造的問題。
問題一、定位錯亂必須改正：廉政委員會不是法定機關，從名稱上來看，似乎是一個如同香港廉政公署般的肅貪機構，但這個委員會只是依行政辦法成立的委員會，基本上只具有諮詢功能，不是法定機構。一來沒有正式調查權，二來令不出市政府，三來沒有預算與助理，只能假借臺北市政府的行政權柄，去向市政府所屬各機構調閱資料。
過去民進黨經常批評國民黨政府有黑機關，批判準則就是法源之有無，現在這個“廉政委員會”，既沒有經過臺“立法院”或臺北市議會同意設立，也不受民意機構的監督。依此而論，確實是黑機關。柯市長曾説過他尊重廉政委員的獨立辦案，此言差矣，因為這個委員會既非獨立，更不能辦案。
問題二、委員認知錯亂，不見基本水準：廉政委員會既然只是諮詢性質，就應該謹守角色，認真針對臺北市政的廉政透明事宜提出建議，但是自從委員會成立以來，未見委員會成員提出廉政的建設性意見，反而只知秉承市長之意，死咬所謂五大“弊案”。許多委員屢屢站上媒體第一線，依據個人主觀認知包裝來自政府機關的公務資料，外流給特定媒體人士，企圖誤導社會對所謂五大“弊案”的認知與態度，全然忘記委員會設置要點中明示委員“應負保密義務”。
至於廉政委員諸公表現欠佳，已具體呈現在報告中，內容品質粗糙，嚴格來講，甚至比不上一般研究生期末作業的水準，包括許多用語不夠精準、甚至經常使用情緒性的措辭，而且還有諸多推論不嚴謹的臆測論述，最誇張的就是居然沒有訪談主要當事人，只在報告公佈、並且揚言移送時才放話説“歡迎當事人主動來説明”。
退一步來説，廉政委員會既然要建請移送司法，當然必須具體指出移送的理由，但是檢視其內容，主要論點卻只是“推論”市長與廠商密會後修改合約涉及圖利，因此建請臺北市政府將全案移送法務部。
廉政委員會並沒有説明，為什麼這場所謂密會的地點，是在臺北市政府會議室。既然是多人參加、在公開場合舉行的公開會議，為何構成“密會”？也忽略了臺“法務部”根本不是移送的受理單位。廉政委員會這些表現，當然沒有發揮應有的諮詢功能，反而陷害臺北市政府于困局，更一步步把柯文哲帶到了民眾最厭惡的政治惡鬥泥淖中。
許多民眾曾經寄望柯文哲能夠打破藍綠惡鬥，給臺灣政壇帶來耳目一新的面貌。回顧過去，柯文哲市長確實也秉持個人坦率風格，積極努力想要推動新市政。可惜的是，廉政委員會的佈局，一開始就定位錯亂，委員們又認知錯亂，終於完全脫離了當初設置的目的，變成了許多知識分子口中的新一代法西斯白色恐怖黑機關。
柯市長一向勇於自我檢討與進化，這也是許多民眾支援他的原因。面對已經荒腔走板的廉政委員會，柯市長應該壯士斷腕，停止再被這個委員會綁架與利用。只要確立法源與定位、整合現有政風功能，並且提高廉政委員會的位階與專業素質，柯市長立即就能推出廉政委員會2.0版來矯正既有過失，從而深化標榜廉政透明的初衷。
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