據臺灣《聯合報》報道，臺灣屏東縣檢方調查認為，該縣漁船遭菲律賓公務船槍擊案中，菲國有八人涉嫌殺人，但菲國認為涉案人數只有兩人，且是防衛過當僅涉及過失殺人，雙方認知差距甚大，致調查結果遲未公佈。
據了解，屏東檢方赴菲調查菲海監船上官兵共二十人，其中十二人屬漁業局等人員未配槍；包括指揮官在內另八人有配槍，檢方調查後認為，八人中，指揮官與開槍打死船員洪石成的隊員，是蓄意殺人，其餘六人則有不確定殺人故意。
屏東檢方調查，開槍的海巡隊員表示，指揮官下令他們開槍前，自己先“示範”開了三槍，隨後下令“fire fire”他們才開槍。
射中船員洪石成的隊員説，他是使用M十四步槍，這把槍是他一人保管使用。他只朝引擎室射擊，是想造成引擎故障，讓漁船失去動力而已，絕對沒有射人的意思。他只開了三槍，就擊中引擎室。
菲方指揮官則一再強調，案發前正追逐一艘大型漁船，廣大興二十八號漁船有阻擾且出現挑釁行為，他才下令開槍。但屏東檢方調查人員和他一起看海監船上的錄影帶，詢問他所説大型漁船位置，他説沒有拍攝，因此錄影帶沒有這艘船。
指揮官坦承示範開槍，但辯稱擔心隊員不知道漁船引擎位置，瞄錯方向，誤傷船員，他才拿M十六步槍示範如何瞄準引擎室開槍，“只開三槍”，完全朝引擎室射擊，不是朝漁船射擊。
臺灣檢方人員追問他既然如此，為何漁船上到處是彈孔，他卻由律師“代答”，檢方發現他對關鍵問題避重就輕欲測謊，他也拒絕。
但臺灣檢方依據菲國提供資料，發現菲官兵出海領取子彈數目和繳回子彈數目，相差一百多發，分析海監船對廣大興開了一百多槍，其中四十五發射中漁船，根本是對漁船瘋狂掃射，因此認為開槍官兵涉及蓄意及不確定殺人行為。
據了解，屏東檢方如以蓄意殺人罪起訴指揮官及射殺洪石成的隊員，依臺灣相關法令最重可處死刑、無期徒刑或十年以上有期徒刑；這項罪名與菲國謀殺罪刑度相同，因菲國沒有死刑，最重可判終身監禁。如依菲方見解僅涉及過失，刑度最重才三年。
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