日前，有報道指出碧生源獨立研發能力不足的問題，對此碧生源方面回應稱這種質疑可能是因為評判標準不同而造成。
日前曾有報道質疑碧生源的産品研發能力，四川新聞網在報道中稱：“業內人士指出，目前看來，碧生源自身的研發團隊對消費者的喜好、市場趨勢的判斷都不甚熟悉，不具備獨自應對市場的能力。……碧生源産品研發成本更是低廉，2008至2010年分別為90萬、190萬和130萬，如此低的研發成本幾乎可以忽略不計。”
碧生源公關部經理在接受中國經濟網記者採訪時稱，判斷一個企業研發投入多還是少的標準是不確定的，不同的企業有不同的標準，而媒體在報道時所用的是怎樣的標準也並不明確，這可能是造成媒體質疑碧生源研發能力的原因之一。
該經理表示研發團隊能力受質疑可能是由於媒體了解不夠深入，他透露，目前碧生源的負責研發工作的副總裁曾任聯合利華茶飲料研發首席科學家，是一位比較知名的植物化學博士，而對於目前碧生源研發方面的具體投入情況則並未透露。
