綜合臺灣媒體報道，陳水扁日前戒護就醫，卻傳出獄方不顧陳水扁選擇醫院的權利，強行送至臺北榮總醫院，陳水扁家屬更是揚言要以不付醫療費表達抗議。
但據臺灣媒體報道，臺北監獄典獄長方子傑表示獄方曾經徵詢過陳水扁與其子陳致中的意見，陳水扁只説自己不願意去三總醫院及林口長庚醫院，但沒説不去榮總醫院，陳致中則是不排除將陳水扁送往臺大醫院及臺北榮總醫院。
方子傑説，對於將陳水扁送往教學醫院檢查治療一事，獄方曾經詢問過陳水扁的意見，陳水扁只表示，自己不想去三總及林口長庚，想去馬偕或是南部的醫院。而陳致中則説，不排除臺大及榮總，加上陳水扁的醫師朋友郭正典也建議送往榮總，接受完整神經醫學的專業檢查，獄方才在評估安全戒護後，做出送往榮總的決定。
方子傑澄清説，“臺北監獄有跟馬偕醫院聯繫，馬偕也有同意，但監獄的立場是馬偕在臺北市，交通不方便，有戒護上的安全考慮，而且會有很多群眾。”
方子傑強調，以陳水扁的卸任最高領導人立場上，馬偕儀器的部份會做優先考慮並且準確評估。方子傑説，監獄立場上，希望上週五就送到教學中心醫院，時間上只有兩三天時間，副典獄長與衛生科長做多方聯繫，經評估臺北榮總的設備較好，且精神科方面很專業，相信在醫療體系裏面，不管哪個醫院都不會拒絕。
方子傑強調，“其實有跟陳水扁、陳致中談過，而且都有錄音”，所以陳水扁不希望去三總，但沒説不去榮總。
臺灣法務部門主管曾勇夫則強調，受刑人送醫院治療，獄方必須考慮受刑人醫療需求、醫院空間環境及戒護安全等因素，因此不能完全依照受刑人的意願。
至於陳水扁也想轉往南部的醫學中心，方子傑則表示，由於陳水扁還有其他案件正在審理，在考慮交通往返的戒護問題後，獄方無法同意。
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